帝肯使用cookie改善我们的网站。继续浏览我们的网站,即表示您接受我们的 cookie政策.

MagicPrep™ NGS 系统

MagicPrep NGS系统是一种新型的实验室自动化设备,简单地按钮即可为Illumina测序平台制备NGS文库。

MagicPrep NGS系统提供了一个完整的解决方案,包括仪器、软件、预优化的脚本、试剂和耗材。

MagicPrep NGS系统集成了文库制备所需的一切;您所需要做的就是添加样本。




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 01 / 概述
***************************************************************************************
***************************************************************************************

NGS文库制备只需一键操作 — 解决了繁琐的手动制备工作。

  • 在手动移液上花费数天时间是超负荷的。在不到10分钟的时间内设置好系统并开始运行,为其他实验预留充足的时间。

  • 可靠且可重复的NGS文库制备,通过将创新的试剂分装技术与经过数十年开发和优化的常规技术相结合,平均成功率>99% *

  • 真正的自动化操作,消除了文库制备过程中代价高昂的错误。通过优化的试剂、耗材和简单的防错操作设置和一致的数据,任何人都可以为Illumina测序构建文库。

10分钟简单的运行准备。

MagicPrep NGS系通的试剂盒包含文库制备所需的所有试剂和耗材。您只需要提供样品。无需预混试剂,无需购买其他试剂。只需将试剂卡插入仪器,一键运行,并继续您的一天。

可靠且可重复。

帝肯新的MagicPrep NGS系统的平均成功率超过了99% *。该系统采用了一种新颖且已验证过的的试剂分配技术,提供可靠且可重复的解决方案,同时最大限度地减少用户错误的可能性。MagicPrep NGS提供了一个完全自动化和可重复的工作流程,允许实验室专注于他们的下一个突破,而不仅仅是文库制备。

真正无人值守的自动化。

MagicPrep NGS系统提供了真正的自动化操作,设备开始运行后不需要额外的用户交互。运行开始后,您就可以专注于其他实验,由MagicPrep NGS负责文库制备。MagicPrep NGS仪器可以在文库不蒸发的情况下保存长达65小时。运行可以随时开始,在您准备好时回收文库即可。




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 02 / DNA测序
***************************************************************************************
***************************************************************************************

Revelo™ DNA-Seq Mech用于MagicPrep NGS系统

Revelo DNA-Seq 文库制备试剂盒提供了在MagicPrep NGS系统上生成DNA测序文库的所有试剂。该试剂盒的输入范围广泛,可适用于50 ng500 ng的片段化基因组DNAUDI接头可满足多样本的混合测序。并与MagicPrep NGS系统一起提供了一个全自动化的DNA-Seq文库制备解决方案,手动准备时间仅需10分钟。

Revelo DNA-Seq Mech试剂盒被用于从100ng三种GC含量不同的细菌基因组(金黄色葡萄球菌(32%GC)、大肠杆菌(50%GC)和类球红细菌(68%GC))的预片段化混合物中制备文库。测序结果显示,每个基因组的读长比例与手动得出的结果相似,表明自动化制备的文库GC偏好低。

片段化DNA的高质量文库

  • 与标准的手动流程相比,优化的工作流程使GC偏差最小化。

  • 高保真PCR扩增最大限度地减少了PCR错误的引入。

  • 无论GC含量高低,均可以提供高覆盖率和均一的细菌基因组。

规格

规格/描述

输入样本类型

输入样本类型

DNA

输入量:

输入量:

50 ng - 500 ng

# 可用反应数:

# 可用反应数:

32

可用样本index数

可用样本index数

多达96个UDI

测序平台

测序平台

Illumina, Singular Genomics

Revelo™ DNA-Seq Enz 用于 MagicPrep NGS系统

Revelo DNA-Seq Enz 文库制备试剂盒提供了在MagicPrep NGS系统上生成DNA测序文库的所有试剂。该试剂盒适用于从50 ng500 ng输入区间的完整基因组DNA,稳健的DNA片段化酶以及UDI接头满足多样本的混合测序。并与MagicPrep NGS系统一起提供了一个全自动化DNA-Seq文库制备的解决方案,手动准备时间仅需10分钟。

使用Revelo DNA-Seq Enz试剂盒,对100ng不同GC含量的三种细菌基因组混合物(金黄色葡萄球菌(32%GC)、大肠杆菌(50%GC)和类球红细菌(68%GC))制备文库。所有基因组都在测序数据中得到了预期的表现。插入片段长度分析显示所有三个基因组的插入大小相似,表明DNA片段化不受GC含量的影响。

均一的DNA片段化

  • 预先优化的DNA片段化为广泛的输入区间简化了工作流程。

  • 无论GC含量如何,均一的DNA片段化都可以从不同的样本类型中获得高质量的数据。

  • 无论GC含量如何,都可为细菌基因组提供稳定的覆盖率和均一性。

规格

规格/描述

输入样本类型

输入样本类型

DNA

输入量:

输入量:

50 ng - 500 ng

# 可用反应数:

# 可用反应数:

32

可用样本index数

可用样本index数

多达96个UDI

测序平台

测序平台

Illumina, Singular Genomics




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 03 / mRNA测序
***************************************************************************************
***************************************************************************************

Revelo™mRNA-Seq用于MagicPrep NGS系统

Revelo mRNA-Seq文库制备试剂盒提供了在MagicPrep NGS系统上制备mRNA测序文库的所有试剂。该试剂盒具有广泛的输入范围,适用于10ng到1000ng的总RNA, UDI接头可满足多样本的混合测序。并与MagicPrep NGS系统一起提供了一个全自动化的mRNA-Seq文库制备解决方案,手动准备时间仅需10分钟。

文库由10ng(16个文库)、100ng(24个文库)或1000 ng(16个文库)的K562总RNA制备获得。数据分析显示,在100倍的输入差异下,常规的文库指标和基因检测结果一致。

高质量的mRNA测序文库

  • 全自动化流程。MagicPrep NGS完成从总RNA开始的所有文库制备步骤,包括多聚腺苷酸转录本的筛选。

  • 均匀覆盖整个转录本,从而在数据分析过程中检测剪接变体和异构体。

  • 高质量的数据,可以实现在100倍的输入差异下获得一致的基因检测。

规格

规格/描述

输入样本类型

输入样本类型

总RNA

输入量:

输入量:

10 ng - 1 μg

# 可用反应数:

# 可用反应数:

32

可用样本index数

可用样本index数

多达96个UDI

测序平台

测序平台

Illumina, Singular Genomics




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 04 / 可靠性
***************************************************************************************
***************************************************************************************

什么是文库成功率?

MagicPrep NGS系统旨在为自动化文库准备提供一个简单、可靠的解决方案。经过大量的测试,以优化的试剂配方、自动化脚本和耗材,最大限度地降低文库失败率。

使用对照样本以推荐的输入量和PCR循环数测试MagicPrep NGS文库制备成功率。如果文库的总回收率大于或等于200ng,则认为文库是成功的。使用片段分析仪确认所有文库的预期文库片段分布。

文库的质量与成功受到样本质量、输入量和样本潜在抑制剂的影响。质量较低的样本可能会得到不一样的成功率。

Magic_Reliability-chart_final

平均成功率>99%*

使用MagicPrep NGS系统将对照样本制备成Illumina测序文库。在10多台不同仪器上进行了共59次(472个样本)文库制备,包括mRNA和DNA。计算所有运行的平均库成功率,不考虑应用程序。总体而言,MagicPrep NGS系统的平均成功率大于99%。

文库一致性

MagicPrep NGS系统在同一运行和不同运行批次均能制备一致的文库。 在同一台仪器上使用Revelo mRNA-Seq试剂盒制备40个文库(5次运行),以100 ngK562RNA文库为输入量。将每个文库的总量绘制成图表,以证明文库得率的一致性。数据显示,每个批次的CV5.8% ~ 16.8%之间,表明每个批次的8个样本的产量一致。此外,在所有5次运行中生成的文库结果是相似的,证明MagicPrep NGS系统有较好的一致性。




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 05 / 常见问题
***************************************************************************************
***************************************************************************************

Instrument

Q1. MagicPrep NGS系统的尺寸和重量是多少?

MagicPrep NGS系统尺寸为58cm × 25cm × 31cm(长×宽×高),仪器重18.8 kg。

Q2. NGS文库制备所需的操作环境条件是什么?

MagicPrep NGS系统制备NGS文库的操作条件是:

  • 室温:20 - 26˚C
  • 相对湿度:30 - 60% (非凝结)
  • 海拔高度:海拔约500米

Q3. MagicPrep NGS系统周围需要多少空间来获得足够的气流?

MagicPrep NGS系统应放置在距离墙壁或其他可能限制气流的物体有足够空间的位置。建议在仪器的两侧和后方留有至少15厘米(6英寸)的无障碍间隙。

Q4. MagicPrep NGS系统的电源要求是什么?

MagicPrep NGS仪器需要以下电源:100-240 VAC, 50-60 Hz。

Q5.  MagicPrep NGS系统包括什么?

MagicPrep NGS系统配有仪器、电源线、样本架和样本架托。

Q6. 我可以将MagicPrep NGS系统与其他试剂一起使用吗?

不能,MagicPrep NGS系统目前只兼容帝肯试剂。

Q7. 我可以用少于8个样本进行MagicPrep NGS文库制备吗?

MagicPrep NGS可以在少于8个样品的情况下运行。但是试剂和耗材只能一次性使用。未使用的试剂不能回收或用于后续实验。

Q8.  Revelo MagicPrep NGS试剂盒套装包括什么?

每个试剂盒够4次(32个样品)实验。每个套装配有4个试剂卡,1管磁珠,4套样本板。

Q1. MagicPrep NGS系统提示错误怎么办?

执行电力循环并重新启动系统。执行一个电源循环,请先关闭MagicPrep NGS系统,并等待LED灯条完全关闭。一旦系统完全关闭,再次通电MagicPrep NGS系统。如果错误仍然存在,请联系帝肯客户支持。

Q2. 如果触摸屏没有反应或对触摸没有反应,我该怎么办?

执行一个电源循环以重新初始化系统。在重新启动系统之前,请确保LED灯条完全关闭。如果错误仍然存在,请联系帝肯客户支持。

Q3. 检测不到样本板或样本板组件,或条码扫描出错,该怎么办?

MagicPrep NGS系统将不适用于已使用过的试剂组合。确保使用全新的试剂与耗材。擦去任何可能遮挡条码读取的水分,并重新放入仪器。如果错误仍然存在,请联系帝肯客户支持。

Q4. 检测不到试剂卡或条码扫描错误,如何处理?

MagicPrep NGS系统将不适用于以前使用过的试剂组合。确保使用全新的试剂与耗材。擦去任何可能遮挡条形码读取的水分,并重新放入仪器。如果错误仍然存在,请联系帝肯客户支持。

DNA-Seq MECH

Q1. Revelo DNA-Seq Mech提供什么材料?

Revelo DNA-Seq Mech试剂盒由样本板套装,试剂卡和单管Agencourt磁珠组成。

Q2. 需要或有用的材料或设备是什么?

以下是实验所需及推荐的设备与耗材的综合清单:

设备

  • 微量移液器:0.5-10 μL、2-20 μL、20-200 μL、200-1000 μL。
  • 微型离心机用于0.2 mL试管或PCR板。
  • Qubit®2.0,3.0或4荧光计(Fisher Scientific)或其他同等荧光计及配件,用于起始DNA和终文库的定量。
  • 5200片段分析系统,安捷伦2100生物分析仪,或等价的核酸电泳分析系统。

试剂

  • Low-EDTA TE缓冲液,1X,pH 8.0 (Fisher Scientific,货号:AAJ75793AP),或无核酸酶水(Fisher Scientific,,货号:AAJ71786K2)用于稀释核酸。
  • 安捷伦高灵敏DNA试剂盒(Agilent, 货号:5067-4626)或等价试剂盒。

供应商及实验耗材

  • 无核酸酶的带滤芯移液枪头。
  • 0.2 mL PCR 8连管或0.2 mL薄壁PCR板。
  • 清洁方案,如DNA OFF™(MP Biomedicals, 货号:11QD0500)。

Q3. 你建议用什么方法来分离RNA ?

我们推荐柱法提取DNA,包括:Qiagen QIAprep Miniprep或DNeasy Miniprep试剂盒,Zymo Quick-DNA试剂盒和Thermo Fisher PureLink Genomic DNA试剂盒。

Q4. 我可以使用苯酚-氯仿提取法进行DNA分离吗?

我们不建议使用这些方法,因为任何残留的有机溶剂都可能会抑制下游酶的活性。如果使用苯酚-氯仿试剂,我们建议在使用试剂盒之前用过柱法进行DNA纯化。

Q5. 生成文库需要多少DNA ?

Revelo DNA- seq Mech可用于50 ng至500 ng高质量纯化DNA的文库制备。超出此范围的输入量可能会影响反应的化学计量,导致产生结果可变或不太满意的欠佳文库。根据分析平台的要求,使用较低的输入量或降解的样本可能会导致文库产量不足。

Q6. 我可以使用Revelo DNA- seq Mech制备任何生物DNA的文库吗 ?

Revelo DNA- seq Mech已使用从人类和细菌样本中分离的DNA进行了测试。然而,任何DNA样本都应该能产生可测序的文库。欲了解更多信息,请联系帝肯NGS技术支持:techserv-gn@tecan.com。

Q7. 在开始这个方案之前,是否有必要对我的DNA进行打断?

是的,输入的DNA必须在使用本试剂盒之前进行预打断。

Q8. 我没有Covaris仪器。我能使用其他方法吗?

在开发MagicPrep NGS DNA-Seq的过程中,我们只评估了Covaris打断的DNA。其他机械打断方式,如超声处理,可能也适合。我们还提供MagicPrep NGS的Revelo DNA-Seq Enz,其特点是对大分子基因组DNA进行酶切。

Q9. Tecan是否提供用于执行实验流程中的打断试剂?

Tecan不提供片段化的打断试剂。我们建议使用Covaris仪器来进行DNA片段分析。

Q10. 我可以一次进行少于8个样本的预处理吗?

Revelo DNA-Seq Mech for MagicPrep NGS每次运行都会进行8个反应的预处理。空的位置不会产生文库。试剂卡和样本板组件不能重复使用。

Q11. 我可以在MagicPrep上修改Revelo DNA-Seq Mech推荐的PCR扩增循环数吗?

是的,用户将有机会从根据样本输入选择的推荐值调整循环数。用户指南中的表2包含了使用循环次数的指南,尽管一些样本在不同的循环数下可能表现更好。

Q12. 我的试剂已经过期。我还能在MagicPrep NGS上运行Revelo DNA-Seq Mech吗?

是的,尽管我们不建议使用过期试剂,但在仪器检测到过期试剂后,用户仍可选择运行该流程。

Q13. MagicPrep NGS的Revelo DNA-Seq Mech试剂会给文库长度增加多少个碱基?

文库的接头长度为133bp。

Q14. 预估的文库片段大小是多少?

MagicPrep NGS的Revelo DNA-Seq Mech 文库将呈现与用户提供的输入片段DNA成比例的长度范围。如果输入的DNA片段为300-350bp,那么文库的总长度将为400-500bp。

Q15. 什么测序仪可以与你们的文库兼容?

MagicPrep NGS的Revelo DNA-Seq Mech文库可与Illumina测序平台兼容,并使用标准版的测序引物。

Q16.我一次可以在测序仪上加载多少样本?

请按照制造商的建议进行文库的QC、定量、荧光平衡,并将扩增文库加载到测序仪上。

Q17. 在读取index时,使用哪种纠错方法能使测序错误的影响最小化?

每个index与任何其他index之间的最小编辑距离为3bp。这允许在混样测序过程中进行纠错。关于index设计策略的更多细节,请参考Faircloth BC, Glenn TC(2012), Not All Sequence Tags Are Created Equal: Designing and Validating Sequence Identification Tags Robust to Indels. PLoS ONE 7(8): e42543. doi:10.1371/journal.pone.0042543。

DNA-Seq ENZ

Q1. Revelo DNA-Seq Mech提供什么材料?

Revelo DNA-Seq Mech试剂盒由样本板套装,试剂卡和单管Agencourt磁珠组成。

Q2.  需要或有用的材料或设备是什么?

以下是实验所需及推荐的设备与耗材的综合清单:

设备

  • 微量移液器:0.5-10 μL、2-20 μL、20-200 μL、200-1000 μL。
  • 微型离心机用于0.2 mL试管或PCR板。
  • Qubit®2.0,3.0或4荧光计(Fisher Scientific)或其他同等荧光计及配件,用于起始DNA和终文库的定量。
  • 5200片段分析系统,安捷伦2100生物分析仪,或等价的核酸电泳分析系统。

试剂

  • Low-EDTA TE缓冲液,1X,pH 8.0 (Fisher Scientific,货号#75793)用于稀释核酸
  • 核酸酶水(Fisher Scientific,货号BP2484)用于稀释核酸。
  • 安捷伦高灵敏DNA试剂盒(Agilent, 货号:5067-4626)或等价试剂盒。

供应商及实验耗材

  • 无核酸酶的带滤芯移液枪头。
  • 0.2 mL PCR 8连管或0.2 mL薄壁PCR板。
  • 清洁方案,如DNA OFF™(MP Biomedicals, 货号:11QD0500)。

Q3. 你建议用什么方法来分离RNA ?

我们推荐柱法提取DNA,包括:Qiagen QIAprep Miniprep或DNeasy Miniprep试剂盒,Zymo Quick-DNA试剂盒和Thermo Fisher PureLink Genomic DNA试剂盒。

Q4. 我可以使用苯酚-氯仿提取法进行DNA分离吗?

我们不建议使用这些方法,因为任何残留的有机溶剂都可能会抑制下游酶的活性。如果使用苯酚-氯仿试剂,我们建议在使用试剂盒之前用过柱法进行DNA纯化。

Q5. 生成文库需要多少DNA ?

Revelo DNA- seq Mech可用于50 ng至500 ng高质量纯化DNA的文库制备。超出此范围的输入量可能会影响反应的化学计量,导致产生结果可变或不太满意的欠佳文库。根据分析平台的要求,使用较低的输入量或降解的样本可能会导致文库产量不足。

Q6. 我可以使用Revelo DNA- seq Mech制备任何生物DNA的文库吗 ?

Revelo DNA- seq Mech已使用从人类和细菌样本中分离的DNA进行了测试。然而,任何DNA样本都应该能产生可测序的文库。欲了解更多信息,请联系帝肯NGS技术支持:techserv-gn@tecan.com。

Q7. 我一次可以做少于8个样本的文库制备吗?

Revelo DNA-Seq Mech每次可以制备8个样本文库。不加样本不会生成文库。试剂盒和样本板组合不能重复使用。

Q8. 我可以修改MagicPrep NGS为Revelo DNA-Seq Mech推荐的PCR循环数吗?

是的,用户可以根据样本输入量选择调整推荐的循环数。用户指南的表2有循环数指南。有些样本使用不同的循环数可能会表现得更好。

Q9. 我的试剂过期了。我还可以用MagicPrep NGS运行Revelo DNA-Seq Mech试剂吗?

可以,虽然我们不建议使用过期试剂,但在仪器检测到使用过期试剂后,用户仍然可以选择继续运行该程序。

Q10. Revelo DNA-Seq Mech的接头增加了多少碱基到文库中?

文库接头长度为133 bp。

Q11. 期望的文库大小是多少?

Revelo DNA- seq Mech文库片段分布范围与用户提供的DNA片段成正比。输入300-350 bp DNA的总文库片段将为400-500 bp。

Q12.  你的文库与哪些测序仪兼容?

Revelo DNA-Seq Mech文库与使用标准测序引物的Illumina测序平台兼容。.

Q13. 我一次可以在测序仪上测多少样本?

请按照制造商的建议进行文库的QC、定量、荧光平衡和将扩增文库加到测序仪上。

Q14. 在读取index时,使用哪种纠错方法能使测序错误的影响最小化?

每个index与任何其他index之间的最小编辑距离为3bp。这允许在混样测序过程中进行纠错。关于index设计策略的更多细节,请参考Faircloth BC, Glenn TC(2012), Not All Sequence Tags Are Created Equal: Designing and Validating Sequence Identification Tags Robust to Indels. PLoS ONE 7(8): e42543. doi:10.1371/journal.pone.0042543。

mRNA-Seq

Q1. Revelo mRNA-Seq提供什么材料?

Revelo mRNA-Seq试剂盒由样本板套装,试剂卡和单管Agencourt磁珠组成。

Q2. 需要或有用的材料或设备是什么?

以下是实验所需及推荐的设备与耗材的综合清单:

设备

  • 微量移液器:0.5-10 μL、2-20 μL、20-200 μL、200-1000 μL。
  • 微型离心机用于0.2 mL试管或PCR板。
  • Qubit®2.0,3.0或4荧光计(Fisher Scientific)或其他同等荧光计及配件,用于起始DNA和终文库的定量。
  • 5200片段分析系统,安捷伦2100生物分析仪,或等价的核酸电泳分析系统。

试剂

  • Low-EDTA TE缓冲液,1X,pH 8.0 (Fisher Scientific,货号:AAJ75793AP),或无核酸酶水(Fisher Scientific,货号:AAJ71786K2)用于稀释核酸。
  • Nuclease-free water (Fisher Scientific, Cat. #BP2484), for diluting nucleic acids
  • 安捷伦高灵敏DNA试剂盒(Agilent, 货号:5067-4626)或等价试剂盒。

供应商及实验耗材

  • 无核酸酶的带滤芯移液枪头。
  • 0.2 mL PCR 8连管或0.2 mL薄壁PCR板。
  • 清洁方案,如DNA OFF™(MP Biomedicals, 货号:11QD0500)。

Q3. 你建议用什么方法来分离RNA ?

我们推荐基于列的方法,包括:

  • Norgen Biotek Total RNA Purification Kit.
  • Zymo Research Quick-RNA™ Kits.
  • Arcturus PicoPure® RNA Isolation Kit.
  • Ambion PureLink® RNA Mini Kit.
  • Qiagen RNeasy Kits.

有机法,如TRIzol ®试剂应采用过柱法进行纯化。

Q4. 我可以使用TRIzol®或其他基于苯酚-氯仿的萃取法进行RNA分离吗?

我们不建议使用TRIzol®或类似的方法,因为任何有机溶剂的残留可能会抑制下游酶的活性。如果使用TRIzol提取的RNA,我们建议在使用建库试剂盒之前对RNA进行过柱纯化。

Q5. 我可以在RNA分离过程中使用Carrier RNA吗?

不能。残留的Carrier RNA会导致数据质量较差。

Q6. 生成文库需要多少RNA ?

Revelo mRNA-Seq可用于10 ng至1 μg的高质量(RIN≥7.0)纯化总RNA的文库构建。超出此范围的输入量可能会影响反应的化学计量,导致产生结果可变或不太满意的欠佳文库。根据分析平台的要求,较低的投入量可能会导致文库产量不足。

Q7.在用Revelo mRNA-Seq处理MagicPrep NGS样本前,我需要进行rRNA去除或poly(A)富集吗?

不需要rRNA去除或poly(A)富集。Revelo mRNA-Seq可直接用于总RNA。

Q8. 你是否推荐DNase处理纯化的总RNA样本?

是的。当使用纯化的总RNA样本时,大量受污染的基因组DNA可能会在此过程中扩增。因此,建议在MagicPrep NGS运行Revelo mRNA-Seq之前进行DNase处理。

Q9. 我可以使用Revelo mRNA-Seq用于任何生物的RNA样本吗?

设计的MagicPrep NGS的Revelo mRNA-Seq试剂盒仅测试过从人类样本中分离的总RNA。然而,任何包含3’-poly(A)序列的RNA样本理论上都可以产生可测序的文库。欲了解更多信息,请联系帝肯NGS技术支持:techserv-gn@tecan.com。

Q10. 我一次可以做少于8个样本的文库制备吗?

Revelo mRNA-Seq试剂盒每次可以制备8个样本文库。不加样本不会生成文库。试剂盒和样本板组合不能重复使用。

Q11.  Revelo mRNA-Seq试剂盒是否可以去除rRNA?

Revelo mRNA-seq利用poly(A)选择靶向聚腺苷化的mRNA转录本。使测序数据中的rRNA最小化。

Q12. 我可以修改推荐的Revelo mRNA-Seq PCR循环数吗?

是的,用户可以根据样本输入量选择调整推荐的循环数。用户指南的表2有循环数指南。有些样本使用不同的循环数可能会表现得更好。

Q13. Revelo mRNA-Seq是链特异性吗?

是的,用Revelo mRNA-Seq制备的文库为链特异性。第一条read序列(read1)为正义链。

Q14. 我的试剂过期了。我还可以在MagicPrep NGS系统上使用这些试剂吗?

可以,虽然我们不建议使用过期试剂,但在仪器检测到使用过期试剂后,用户仍然可以选择继续运行该程序。

Q15. Revelo mRNA-Seq试剂盒的接头增加了多少碱基到文库中?

文库接头长度为133 bp。

Q16. 期望的文库大小是多少?

Revelo mRNA-Seq文库片段分布范围与用户提供的DNA片段成正比。输入300-350 bp DNA的总文库片段将为400-500 bp。

Q17. 你的文库与哪些测序仪兼容?

Revelo mRNA-Seq文库与使用标准测序引物的Illumina测序平台兼容。

Q18. 我一次可以在测序仪上测多少样本?

请按照制造商的建议进行文库的QC、定量、荧光平衡和将扩增文库加到测序仪上。

Q19. 在读取index时,使用哪种纠错方法能使测序错误的影响最小化?

每个index与任何其他index之间的最小编辑距离为3bp。这允许在混样测序过程中进行纠错。关于index设计策略的更多细节,请参考Faircloth BC, Glenn TC(2012), Not All Sequence Tags Are Created Equal: Designing and Validating Sequence Identification Tags Robust to Indels. PLoS ONE 7(8): e42543. doi:10.1371/journal.pone.0042543。




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 06 / 网络研讨会视频
***************************************************************************************
***************************************************************************************

MagicPrep NGS研讨会合集

行业专家分享他们对最新应用程序和工作流程的见解,以帮助实验室跟上最前沿的技术

发现网络研讨会,可以帮助低通量自动化的NGS文库制备空前轻松使用MagicPrep NGS。这个强大的系统为DNA-Seq和mRNA-Seq提供了一致的和可重复的结果,使实验室能够专注于他们的下一个突破,而不只是文库制备。

微重力对人体致病性生物膜和微生物生态系统的影响

Christopher Mason博士,美国威尔康奈尔医学院基因组学、生理学和生物物理学教授

自动化NGS文库制备加速疫苗研发

Graham Freimanis博士,英国珀布赖特研究院高通量测序负责人

自动化NGS文库制备用于癌症研究

Gopal Iyer博士,美国威斯康星大学麦迪逊分校的人类肿瘤学系助理教授

临床宏基因组测序用于感染诊断、废水监测和疫情调查

Charles Chiu博士加州大学旧金山分校感染性疾病部门的检验医学及医学教授

The role and importance of library preparation in personalized phage therapy

Dr. Austen Terwilliger, Director of Operations, TAILΦR Labs, Baylor College of Medicine




***************************************************************************************
***************************************************************************************
Tab 07 / 文献 & 软件
***************************************************************************************
***************************************************************************************

MagicPrep NGS ソフトウェア アップデート v. 1.2 が利用可能になりました

このソフトウェアアップデートでは、Singular Genomics G4™ シーケンス プラットフォーム用の新しい MagicPrep NGS キットを使用するために必要なプロトコルが組み込まれています。

さらにMagicPrep NGS の実行やその他のワークフローの改善とバグ修正を簡単に文書化できるように、機器のイベント ログに追加の実行情報も提供されます。

 

ダウンロードはこちらから

产品手册

Tecan’s MagicPrep NGS is a new type of automation solution for NGS library preparation that just works. Reimagined and redesigned, it offers a simple solution that anyone can use. Tecan’s MagicPrep NSG system comes with numerous benefits and features

应用说明

Next generation sequencing (NGS) is a standard tool in academic and clinical research. Since the original Illumina NGS platforms were introduced, there have been significant improvements in throughput, turnaround time and cost of NGS. The process for NGS library construction, however, has not significantly changed. While there have been some innovations, this process still follows the basic step of first and second strand cDNA synthesis (for RNA), end repair, adaptor ligation and PCR amplification.

Routine manual preparation of amplicon-based libraries can be burdensome to personnel, requiring at least 5 hours of assay time and allots only 0.5 hours of uninterrupted walkaway time. MagicPrep™ NGS is an ideal solution for saving time by automating the generation of amplicon-based libraries.

Tecan’s MagicPrep™ NGS system is a unique solution for fully automated preparation of NGS libraries. The system combines hardware, software, reagents, and consumables to provide a complete solution that just works. After an initial 10-minute setup, the user can walk away and come back to finished NGS libraries (Figure 1). The instrument simultaneously produces 8 libraries, providing an automated solution for sequencing library preparation for mid- to lowthroughput laboratories.

海报

Routine manual preparation of genomic libraries is an arduous process taking up to ~5 to ~7.5 hours of personnel time. MagicPrep NGS is a hands-free, walkaway solution for saving time by automating the preparation of both DNA and RNA libraries.

Routine manual preparation of genomic libraries is an arduous process that consumes between ~5 to ~7.5 hours prior to sequencing. MagicPrep NGS is a hands-free, walkaway solution for saving time by automating the preparation of both DNA and RNA libraries.

操作手册

安全数据表

Revelo mRNA-Seq for MagicPrep NGS kit Safety Data Sheet

Revelo DNA-Seq Enz for MagicPrep NGS kit Safety Data Sheet

Revelo DNA-Seq Mech for MagicPrep NGS kit Safety Data Sheet

*成功率是基于平均的内测数据得出的。样本质量和可变性可能会影响成功率。



本产品仅限于研究使用,不用于临床诊断。