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从每周只有几个样本到每天几百个样本,NGS样本的自动化制备使你能为(NGS)可重复地创建高质量的文库。
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Tab 01 / 概述
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Validation and verification-ready Tecan’s reagents and 3rd party’s kits to develop automated NGS library prep protocols to ensure excellent performance in any lab.
From plug-and-play to high to highly flexible automated solutions. Now you can walk-away with confidence.
From reagents, automation, and consumables to application expertise – we support you every step of the way.
From low to high throughput, turnkey solutions to OEM development, our comprehensive NGS library prep solutions allow scientists to save time on library prep and focus on what matters most.
We continually strive to offer innovative, accessible and always reliable solutions.
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Tab 02 / Dreamprep® NGS解决方案
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输出
包含的软件包
所有组件2在不同的文库制备试剂盒中都有很高的性能
通过集成酶标仪和NuQuant®3技术实现
实现更快、更高效的工作流程
机械臂的并行移动提高了生产力
人性化的界面,使您的日常操作更便利
线上热循环仪(ODTC)可延长无人值守的时间
平台结合了Fluent®自动化工作站、Infinite® 200 Pro Reader F Nano+和帝肯NGS文库制备试剂盒的先进技术,通过一个简单的自动化工作流程中生成可测序的NGS文库。
帝肯的创新核心技术NuQuant3试剂和集成的Infinite酶标仪能在一个平板上同时测量终文库,不会造成不必要的样品损失。
1) Number of samples processed in walk-away mode is determined by the NGS protocol
2) Ring magnet plates and POGO® adapter with Spring Cushion Technology manufactured by ALPAQUA® Engineering, LLC. Beverly, USA.
2) Thermal devices (Cold Plate Liquid-Cooled, CPLC) and ODTC® manufactured by Inheco© Industrial Heating and Cooling GmbH. Martinsried, Germany.
2) BioShake®3000-T elm manufactured by QInstruments® GmbH. Jena, Germany.
2) Infinite® 200 PRO F Nano+ Reader is a product of Tecan Trading AG, Switzerland.
3) NuQuant® is a registered trademark of Tecan Group Ltd., Männedorf, Switzerland or of Tecan Genomics, Inc., Redwood City, USA.
Example methods have not been validated. Please make a copy of these methods to customize them to accommodate and validate your workflow according to your desired intended use and laboratory protocols. Tecan makes no claims regarding the performance of the example methods.
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Tab 03 / 文库制备试剂
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帝肯已经开发并优化了自己的NGS文库制备试剂,可用于广泛的样本类型。这些试剂已经在帝肯自动化平台上进行了验证,从样本到均一化文库,为您提供完整的解决方案 。
展示更多Universal Plus™ mRNA-Seq试剂盒具有强大的端到端工作流程,编码转录本的输入范围宽泛。Universal Plus™ mRNA-Seq 文库在Fluent®自动化工作站上可以在9小时内完成制备、定量、均一化化和混样,而手动或自动库制备和qPCR定量则需要14小时以上。
该mRNA测序文库制备试剂盒的主要功能包括:
Trio RNA Seq提供了一个完整的流线型文库制备解决方案,它结合了三种核心技术来捕获稀有的转录物和低丰度病原体。与标准的RNA测序工作流程相比,Trio成熟的扩增技术(单引物等温扩增,SPIA®)可产生更多用于文库制备的分子,从有限的样本中获得宝贵的生物学信息。
该RNA文库制备试剂盒的主要功能包括:
Celero EZ DNA-Seq文库制备试剂盒是一个简单、单管、只需加液的工作流程,只有一个扩增后的磁珠纯化步骤。在Fluent®自动化工作站上,Celero DNA文库的制备、定量、均一化和混样时间不到4小时。
这个DNA-Seq文库制备试剂盒的主要亮点包括:
*NuQuant技术仅适用于接头A板(96个UDI指数)。
Ovation Ultralow System V2是一个用于超低投入量的DNA文库制备试剂盒。该试剂盒包括我们专有的DimerFree®技术,该技术减少了多余的接头二聚体,从你的测序数据中获得更多的有效测序数据。Ultralow V2 DNA文库在Fluent®自动化工作站上可以在三个小时内完成制备。
主要特点包括:
Allegro靶向基因分型使用二代测序为多种生物的靶向测序提供了一种快速、可扩展、经济高效的方法。Allegro使用专利技术的单引物富集技术(SPET)方法专门针对感兴趣的区域,通过捕获每个靶向测序数据的SNP或基因型特异位点,提供信息丰富的测序数据。其结果是极好的测序效率,可实现快速的可扩展性和每个位点最低的可用成本
主要特点
TruSeq Nano DNA样本制备试剂盒能够对可用DNA量有限的样品进行有效检测。该试剂盒在Freedom EVO® NGS工作站上的自动化工作流程包括简单的基于磁珠的片段筛选,并且可以在一天之内完成多达48个样本的制备,只需很少的动手时间。
TruSeq DNA PCR-Free样本制备试剂盒能够节省DNA样本的实验时间。用户友好的TouchTools™界面指导实验人员进行自动化设置,以最小的用户干预为单端、双端和index测序提供高度可重复的和可测序的DNA文库。
RNA测序(RNA-Seq)是发现、分析和量化RNA转录本的有力方法。使用Illumina二代测序技术,特异链信息识别了从特定RNA转录本中获得的DNA链,增加了转录本注释的信心,并提高了反义调控的可见性。
Freedom EVO NGS工作站上Illumina TruSeq Stranded Total RNA流程的自动化实现了将总RNA转换为已知链的模板分子库,用户干预最少。Freedom EVO NGS工作站提供高质量的文库制备,交叉污染风险最小。
TruSeq RNA Access文库制备协议是对福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)档案组织样本进行低成本测序的理想解决方案。集成的富集步骤可以适应低浓度的DNA,自动工作流程允许并行构建多达48个文库,在用户干预有限和交叉污染风险最小的情况下生成高质量的文库。
Nextera Rapid Capture流程的自动化友好工作流程与Freedom EVO NGS工作站相结合,为文库制备和外显子组富集提供了更快、更高效的解决方案。使用自动化的Nextera Rapid Capture流程,只需一天半的时间就能完成样本制备,第二天就能获得测序数据结果。
人们对HLA基因测序的兴趣越来越大,因为与血清型分析等经典技术相比,它能更好地确定组织供体和受体的HLA概况。
Illumina TruSight HLA v2.0测序板是一种可靠而简单的检测指标,旨在生成用于HLA特征分析的NGS文库。在Freedom EVO NGS工作站上的自动化工作流程允许对多达24个样本的11个HLA位点进行测序,最大限度地减少了交叉污染的风险和文库制备期间的人为错误。
扩增子测序是一种有针对性的方法,用于鉴定和分析基因组特定区域的变异。PCR产物的测序提供了具有成本效益的变异鉴定和特征分析。Freedom EVO NGS工作站上的TruSeqCustom Amplicon Low Input文库制备工作流程的自动化提供了一个快速有效的解决方案。这种设置能够从低输入样本中生成高质量的文库--从低至10ng的基因组DNA开始。
NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina使用 “dUTP ”方法,即使从低质量的RNA中也能产生出色的产量和高质量的定向文库。每次可从广泛的输入材料中制备多达96个文库,10 ng - 1 µg总RNA用于poly(A) mRNA富集,5 ng - 1 µg用于rRNA消除。
NEBNext Ultra II DNA文库制备工作流程结合了末端修复和dA-tailing步骤,以最少的纯化来减少样品制备时间。每次运行可制备多达96个文库,并使用例如NEBNext Multiplex Oligos for Illumina进行复用。
该流程允许输入从500 pg到1 μg的DNA浓度以及FFPE样品中制备高度可重复的文库,以最小的用户干预提供1到96个样本的灵活处理。
安捷伦的SureSelect XT Target Enrichment系统为人类和其他物种提供了一整套外显子组试剂盒,以及DNA和RNA捕获的定制试剂盒。
单击此处获取应用说明,说明使用Freedom EVO NGS自动化工作站上的SureSelect XT目标富集系统并行处理多达48个样本。
罗氏NimbleGen公司的SeqCap EZ文库制备试剂盒是一种基于解决方案的捕获系统,能从DNA测序库中富集整个外显子组或自定义感兴趣的区域。根据罗氏NimbleGen的规范,SeqCap EZ协议涵盖外显子组设计、基因板和定制内容设计。
点击这里查看应用说明,描述了NimbleGen SeqCap EZ与KAPA™ HTP文库制备结合NimbleGen SeqCap接头试剂盒A和/或B的自动化流程。该流程允许制备多达96个文库,并捕获多达24个文库。
Ion AmpliSeq Library Kit 2.0能在单孔中快速制备12-25,000个组合的PCR NGS文库。
在Freedom EVO NGS工作站上,使用10ng的DNA或RNA,可以在6小时内完成多达96个样本的自动化文库制备。TouchTools操作界面最大限度地减少了动手时间和培训要求,指导用户完成流程选择和工作台面设置的每个阶段。
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Tab 04 / 已验证的NGS流程
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Method qualified/verified by vendor1
Method qualified/verified by Tecan1
Method custom developed2
1) Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. Libraries prepared with
these methods meet the kit vendor’s specifications and/or perform comparably to those prepared manually. Sequenced libraries were
assessed either by the vendor (vendor qualified/verified) or by Tecan (Tecan qualified/verified).
2) Automated method developed according to specific customer need. Libraries tested by the customer.
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Tab 05 / FREEDOOM® EVO NGS工作站
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要为可靠的二代测序本高质量的文库,有许多事情你必须做对,那么为什么你的液体处理流程还存在不必要的复杂性?
Freedom EVO NGS工作站上的NGS样本制备自动化提高了产量和可重复性,通过TouchTools™操作界面指导用户完成流程选择和工作站设置的每一步。
Freedom EVO NGS工作站配备了创新的气动移液技术,使用八通道移液臂(1)确保精确移液,从1,000 µl到0.5 µl 。该工作站包括三个Inheco CPAC装置;(2)为保证试剂的冷却,并为酶反应步骤提供最佳条件,Inheco Thermoshake加热振荡器(3),一个96位Alpaqua 96S Super Magnet Plate磁力板分离器(4)和一个RoMa抓板机械臂(5),用于高效的磁珠纯化。此外,紧凑的工作台面为多达12个吸头盒(6)提供了存储空间,允许更长的无人值守运行。
精确性: Freedom EVO的精确自动化确保了高质量结果所需的可重复性,有一系列合格的测序验证流程可供选择。
灵活性: 不受批次处理要求的限制。无论您需要处理6个、13个、19个、40个甚至96个样本,都只需要运行所需的,从而节省试剂
简单: 你不需要成为自动化专家。通过简单的触摸屏界面,您可以立即开启设备,快速设置运行,并对工作流程充满信心。
TouchTools应用程序的启动屏幕让操作员通过触摸按钮选择所需的流程。循序渐进的的用户说明有助于避免在工作台面设置过程中的潜在错误,以确保正确的初始条件。然后,选择确认屏幕提供了一个摘要,作为开始运行前的最后检查,使实验室里的任何人都能轻松使用该仪器。
The Leiden University Medical Center has integrated the Freedom EVO® NGS workstation into its molecular diagnostic testing and clinical research workflows. Taking advantage of this preconfigured solution, the center was quickly able to commission the platform for routine testing, while still having the flexibility to develop new protocols and conduct research studies.
The University of North Carolina (UNC) has automated its major sample preparation protocols for next generation sequencing on a Freedom EVO® workstation, enabling more efficient processing.
The GeT genomics facility near Toulouse has been developing a series of automated NGS protocols in collaboration with Tecan – including Illumina’s TruSeq® DNA and RNA kits, as well as Bioo Scientific’s NEXTflex™ PCR-Free Modules – on two Freedom EVO® workstations, helping to improve throughput and reliability for a wide range of projects.
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Tab 06 / 质量检测
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NGS文库定量是成功测序的一个关键步骤。准确确定可测序的分子量对新的高通量测序仪(如NovaSeq系统)意义重大。
帝肯NuQuant®是一种新颖的文库定量方法,可以准确测量文库的摩尔浓度,而不需要单独进行片段大小分析。这种专有的方法使用了一种荧光标签,在文库制备过程中被嵌入到文库分子中。NuQuant与文库长度无关,允许使用荧光仪直接测量文库的摩尔浓度,如Infinite F Nano+多功能酶标仪。
在Infinite F Nano+酶标仪上进行NuQuant文库定量,不需要额外的手工qPCR或毛细管电泳步骤,节省了大量时间、资源和宝贵的文库。
在Fluent ®自动化工作站的96孔板上完成DNA终文库的纯化后,在Infinite酶标仪上测量文库和标准品的荧光量。然后为每个文库确定的摩尔值可用于均一化和Illumina平台的测序。
DNA定量可以通过使用荧光染料(如PicoGreen®或QuantiFluor™)或测量整个DNA样本的吸光度来实现。DNA定量和均一化工作流程通常包括以下步骤:
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Tab 07 / 文献资料
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仅限于科研 – 不用于临床诊断。