应用与解决方案 - 基因组学

概述

咨询价格

帝肯的NGS文库预处理解决方案旨在满足您的需求并加速您的研究。

把文库制备留给我们，把时间留给更重要的事。

为Tecan试剂和第三方试剂盒开发自动化NGS文库制备流程已经过验证，并已准备就绪，以确保在任何实验室中都具有出色的性能。

可靠和可重复的NGS文库制备方案。

从即插即用到高度灵活的自动化解决方案。现在你可以自信地离开实验室了。

技术成熟和知识专业的一体化解决方案。

从试剂、自动化和耗材到应用的专业知识——我们支持您的每一步研究。

产品特色

从低通量到高通量，从一体化解决方案到OEM开发，我们全面的NGS文库制备解决方案使科学家能够节省文库准备时间并专注于更重要的事情。

Tecan试剂

• 适用于广泛的样本类型
• DNA-Seq和RNA-Seq的输入量低至10 pg

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方案手册

MagicPrep™ NGS

• 8个样本/运行
• 即插即用
• 与Tecan的NGS试剂(DNA和mRNA-seq)一起使用

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方案手册

紧凑型DreamPrep® NGS

• 每次运行样本可多至48个
• 台式的解决方案
• 开放平台，兼容多种NGS流程

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方案手册

DreamPrep® NGS

• 每次运行多达96个样品
• 高通量
• 开放平台，兼容多种NGS流程

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方案手册

为OEM合作伙伴定制系统

• 根据您的要求和监管需求设计
• 针对OEM合作伙伴的试剂盒进行了优化

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点击这里

合作推进基因组学

我们不断努力提供创新、易用和始终可靠的解决方案。

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DreamPrep NGS和紧凑型DreamPrep NGS

用于NGS文库预处理的自动化解决方案

灵活的配置，为不同的NGS流程提供均一和可测序的文库，人工干预最少，可以满足不同通量的需求。

两种解决方案利用最先进的Fluent^®自动化工作站，提供非凡的精度，无与伦比的效率，以及实现跨不同通量的无缝整合.

DreamPrep NGS

DreamPrep™ NGS

高通量（高达384个样本/天
52个板位
配备了酶标仪和ODTC，用于实现无人值守的完整NGS工作流程

输出

使用Tecan NGS试剂盒 Celero™，每次运行96个DNA文库，时间少于4小时
使用帝肯NGS试剂盒 Universal Plus™ mRNA，每次运行96个RNA文库，耗时9小时
靶向DNA基因分型

使用帝肯NGS试剂盒 Allegro®每天运行384个样本
使用帝肯NGS试剂盒 Celero和QIAseq SARS-CoV-2引物组合的帝肯 NGS流程，每天运行384个样本

包含的软件包

Touchtools™: 与平台进行直观互动
Introspect™: 性能数据分析
FluentControl™: 全局系统管理

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紧凑型DreamPrep NGS

DreamPrep™ NGS Compact

中低同量（8-48个样本/天）
占地面积较小，有30个板位
三种灵活的配置，满足客户的不同要求

有三种配置可供选择，并可在任何时候实现升级

基础款: 提高生产力，因为所有的液体转移和孵育都在平台的覆盖范围内

中阶款: 延长无人值守时间，并通过简单地添加ODTC来实现PCR扩增

全能款: 通过包括Infinite® 200 Pro Reader F Nano+，在你的NGS工作流程中整合定量和均一化功能

包含的软件包

Touchtools™: 与平台进行直观互动
Introspect™: 性能数据分析
FluentControl™: 全局系统管理

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用我们的NGS方案拥抱卓越的液体处理新时代，彻底改变您的工作流程：

开放而灵活的平台

所有组件2在不同的文库制备试剂盒中都有很高的性能

样本无损的快速质控和均一化

通过集成酶标仪和NuQuant®³技术实现

使用帝肯NGS试剂以实现最佳性能

实现更快、更高效的工作流程

处理速度快

机械臂的并行移动提高了生产力

用触摸屏进行直观交互

人性化的界面，使您的日常操作更便利

无人值守方案

线上热循环仪（ODTC）可延长无人值守的时间

用DreamPrep NGS解决方案扩展你的NGS工作流程

平台结合了Fluent®自动化工作站、Infinite® 200 Pro Reader F Nano+和帝肯NGS文库制备试剂盒的先进技术，通过一个简单的自动化工作流程中生成可测序的NGS文库。

MagicPrep™ NGS 只需按键就能进行NGS文库制备

正在寻找更低的通量？MagicPrep NGS是一款新仪器，简单的按钮即可为Illumina测序平台制备NGS文库。

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在几分钟内而不是几小时内进行稳健的质控

帝肯的创新核心技术NuQuant3试剂和集成的Infinite酶标仪能在一个平板上同时测量终文库，不会造成不必要的样品损失。

DreamPrep NGS简单、快速和精确。

保存试剂和样品

一个振动器模块和三个温控模块，用于优化文库制备

Oxford Nanopore's Ligation Sequencing Kit XL V14 automated on the DreamPrep NGS workstation

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DreamPrep NGS一直处于病毒监测的前沿

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帝肯耗材提高了实验结果的可靠性

批准功能（MAF）防止对已验证的协议进行未经授权的更改

1) Number of samples processed in walk-away mode is determined by the NGS protocol

2) Ring magnet plates and POGO® adapter with Spring Cushion Technology manufactured by ALPAQUA® Engineering, LLC. Beverly, USA.
2) Thermal devices (Cold Plate Liquid-Cooled, CPLC) and ODTC® manufactured by Inheco© Industrial Heating and Cooling GmbH. Martinsried, Germany.
2) BioShake®3000-T elm manufactured by QInstruments® GmbH. Jena, Germany.
2) Infinite® 200 PRO F Nano+ Reader is a product of Tecan Trading AG, Switzerland.
3) NuQuant® is a registered trademark of Tecan Group Ltd., Männedorf, Switzerland or of Tecan Genomics, Inc., Redwood City, USA.

Example methods have not been validated. Please make a copy of these methods to customize them to accommodate and validate your workflow according to your desired intended use and laboratory protocols. Tecan makes no claims regarding the performance of the example methods.

用于Illumina测序平台的帝肯NGS文库制备试剂

帝肯已经开发并优化了自己的NGS文库制备试剂，可用于广泛的样本类型。这些试剂已经在帝肯自动化平台上进行了验证，从样本到均一化文库，为您提供完整的解决方案。

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Integrated

Universal Plus™ mRNA-Seq

Universal Plus™ mRNA-Seq试剂盒具有强大的端到端工作流程，编码转录本的输入范围宽泛。Universal Plus™ mRNA-Seq 文库在Fluent®自动化工作站上可以在9小时内完成制备、定量、均一化化和混样，而手动或自动库制备和qPCR定量则需要14小时以上。

该mRNA测序文库制备试剂盒的主要功能包括：

宽泛的动态输入范围：10ng到1ug
DimerFree®技术减少了接头二聚体
整合NuQuant®文库定量方法，无需额外成本，即可准确定量文库浓度（nM）
整合的AnyDeplete®技术有助于在文库制备后去除不需要的转录本，以最大限度地提高有效的测序数据。
可提供多达192个双端唯一index序列的接头（UDI），以增加测序混样量。

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Trio RNA-Seq™

Trio RNA Seq提供了一个完整的流线型文库制备解决方案，它结合了三种核心技术来捕获稀有的转录物和低丰度病原体。与标准的RNA测序工作流程相比，Trio成熟的扩增技术（单引物等温扩增，SPIA®）可产生更多用于文库制备的分子，从有限的样本中获得宝贵的生物学信息。

该RNA文库制备试剂盒的主要功能包括：

RNA测序解决方案非常适合液体活检、FFPE、鼻拭子和其他超微量输入或降解的挑战性样本
宽泛的输入范围：500 pg到50 ng
DimerFree®技术减少了接头二聚体
使用AnyDeplete®技术去除文库制备后不需要的转录本，最大限度地提高有效的测序信数据。

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Celero™ EZ DNA-Seq

Celero EZ DNA-Seq文库制备试剂盒是一个简单、单管、只需加液的工作流程，只有一个扩增后的磁珠纯化步骤。在Fluent®自动化工作站上，Celero DNA文库的制备、定量、均一化和混样时间不到4小时。

这个DNA-Seq文库制备试剂盒的主要亮点包括：

广泛的动态输入范围从10到500ng
仅加试剂，工作流程仅三步
优化酶切法
DimerFree®技术消除了接头二聚体
集成了NuQuant®*文库定量方法，无需额外的费用，可准确定量文库浓度（单位：nM）
可提供384个UDI接头组合以增加混样量

*NuQuant技术仅适用于接头A板（96个UDI指数）。

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Ovation® Ultralow System V2

Ovation Ultralow System V2是一个用于超低投入量的DNA文库制备试剂盒。该试剂盒包括我们专有的DimerFree®技术，该技术减少了多余的接头二聚体，从你的测序数据中获得更多的有效测序数据。Ultralow V2 DNA文库在Fluent®自动化工作站上可以在三个小时内完成制备。

主要特点包括：

DNA测序解决方案是细胞系的理想选择，包括新鲜或FFPE组织、液体活检、游离RNA和超微量的RNA样本
10 pg到100 ng的超低输入范围
DimerFree技术减少了接头二聚体

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Allegro®靶向基因分型V2

Allegro靶向基因分型使用二代测序为多种生物的靶向测序提供了一种快速、可扩展、经济高效的方法。Allegro使用专利技术的单引物富集技术（SPET）方法专门针对感兴趣的区域，通过捕获每个靶向测序数据的SNP或基因型特异位点，提供信息丰富的测序数据。其结果是极好的测序效率，可实现快速的可扩展性和每个位点最低的可用成本

主要特点

输入范围：10到100ng
简单的单管流程，可在24小时内完成
数百个标记和增加的多重混样效率可以节省SNP的检测成本
能够为任何测序基因组设计探针池
具有3072个Metaplex®标记的高通量多重混样选择

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Qualified

Illumina合作方案

帝肯与关键研究中心和Illumina合作，开发了经过优化、测试和测序验证的自动化NGS样本制备方案，以确保在任何实验室中都有出色的性能。

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TruSeq Nano DNA

TruSeq Nano DNA样本制备试剂盒能够对可用DNA量有限的样品进行有效检测。该试剂盒在Freedom EVO® NGS工作站上的自动化工作流程包括简单的基于磁珠的片段筛选，并且可以在一天之内完成多达48个样本的制备，只需很少的动手时间。

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TruSeq PCR Free

TruSeq DNA PCR-Free样本制备试剂盒能够节省DNA样本的实验时间。用户友好的TouchTools™界面指导实验人员进行自动化设置，以最小的用户干预为单端、双端和index测序提供高度可重复的和可测序的DNA文库。

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Nextera XT

Nextera XT DNA文库制备试剂盒能够从PCR扩增子、质粒和小基因组中有效地构建高质量的文库，使用的方案针对低至1ng的DNA样本而优化。

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TruSeq Stranded mRNA

RNA测序（RNA-Seq）是发现、分析和量化RNA转录本的有力方法。使用Illumina二代测序技术，特异链信息识别了从特定RNA转录本中获得的DNA链，增加了转录本注释的信心，并提高了反义调控的可见性。

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TruSeq Stranded Total RNA

Freedom EVO NGS工作站上Illumina TruSeq Stranded Total RNA流程的自动化实现了将总RNA转换为已知链的模板分子库，用户干预最少。Freedom EVO NGS工作站提供高质量的文库制备，交叉污染风险最小。

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TruSeq RNA Access

TruSeq RNA Access文库制备协议是对福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）档案组织样本进行低成本测序的理想解决方案。集成的富集步骤可以适应低浓度的DNA，自动工作流程允许并行构建多达48个文库，在用户干预有限和交叉污染风险最小的情况下生成高质量的文库。

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Nextera Rapid Capture

Nextera Rapid Capture流程的自动化友好工作流程与Freedom EVO NGS工作站相结合，为文库制备和外显子组富集提供了更快、更高效的解决方案。使用自动化的Nextera Rapid Capture流程，只需一天半的时间就能完成样本制备，第二天就能获得测序数据结果。

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TruSight® HLA v2.0 Sequencing Panel

人们对HLA基因测序的兴趣越来越大，因为与血清型分析等经典技术相比，它能更好地确定组织供体和受体的HLA概况。

Illumina TruSight HLA v2.0测序板是一种可靠而简单的检测指标，旨在生成用于HLA特征分析的NGS文库。在Freedom EVO NGS工作站上的自动化工作流程允许对多达24个样本的11个HLA位点进行测序，最大限度地减少了交叉污染的风险和文库制备期间的人为错误。

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TruSeq ® Custom Amplicon Low Input

扩增子测序是一种有针对性的方法，用于鉴定和分析基因组特定区域的变异。PCR产物的测序提供了具有成本效益的变异鉴定和特征分析。Freedom EVO NGS工作站上的TruSeqCustom Amplicon Low Input文库制备工作流程的自动化提供了一个快速有效的解决方案。这种设置能够从低输入样本中生成高质量的文库--从低至10ng的基因组DNA开始。

已验证的Illumina测序平台试剂

Tecan与NGS样品制备试剂盒供应商合作，开发、测试和测序验证了NGS样品制备协议，使您有时间专注于分析测序结果。

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Verified

NEBNext Ultra II Directional RNA

NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina使用 “dUTP ”方法，即使从低质量的RNA中也能产生出色的产量和高质量的定向文库。每次可从广泛的输入材料中制备多达96个文库，10 ng - 1 µg总RNA用于poly(A) mRNA富集，5 ng - 1 µg用于rRNA消除。

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NEBNext Ultra II DNA

NEBNext Ultra II DNA文库制备工作流程结合了末端修复和dA-tailing步骤，以最少的纯化来减少样品制备时间。每次运行可制备多达96个文库，并使用例如NEBNext Multiplex Oligos for Illumina进行复用。

该流程允许输入从500 pg到1 μg的DNA浓度以及FFPE样品中制备高度可重复的文库，以最小的用户干预提供1到96个样本的灵活处理。

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SureSelect XT Target Enrichment

安捷伦的SureSelect XT Target Enrichment系统为人类和其他物种提供了一整套外显子组试剂盒，以及DNA和RNA捕获的定制试剂盒。

单击此处获取应用说明，说明使用Freedom EVO NGS自动化工作站上的SureSelect XT目标富集系统并行处理多达48个样本。

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NimbleGen SeqCap EZ Library

罗氏NimbleGen公司的SeqCap EZ文库制备试剂盒是一种基于解决方案的捕获系统，能从DNA测序库中富集整个外显子组或自定义感兴趣的区域。根据罗氏NimbleGen的规范，SeqCap EZ协议涵盖外显子组设计、基因板和定制内容设计。

点击这里查看应用说明，描述了NimbleGen SeqCap EZ与KAPA™ HTP文库制备结合NimbleGen SeqCap接头试剂盒A和/或B的自动化流程。该流程允许制备多达96个文库，并捕获多达24个文库。

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Co-developed

IonTorrent测序

与赛默飞世尔科技公司合作开发的用于Ion AmpliSeq™文库制备的经过测序验证的灵活流程。

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Ion AmpliSeq libraries and panels

Ion AmpliSeq Library Kit 2.0能在单孔中快速制备12-25,000个组合的PCR NGS文库。

在Freedom EVO NGS工作站上，使用10ng的DNA或RNA，可以在6小时内完成多达96个样本的自动化文库制备。TouchTools操作界面最大限度地减少了动手时间和培训要求，指导用户完成流程选择和工作台面设置的每个阶段。

下载应用说明

Please read the method definitions in the bottom section.
Supplier	Kit	DreamPrep® NGS	DreamPrep® NGS Compact	Freedom EVO® NGS workstation
Tecan
DNA-Seq	Celero™ DNA-Seq	_T
	Celero™ EZ DNA-Seq	_T		_T
	Ovation® Ultralow System V2	_T
RNA-Seq	Revelo™ RNA-Seq	_T		_T
	Universal Plus Total RNA-Seq	_T
	Universal Plus™ mRNA-Seq	_T		_T
Targeted enrichment	Celero™ EZ DNA-Seq and QIAseq SARSCoV- 2 Primer Panel for SARS-CoV-2 sequencing	_T
Targeted genotyping	Allegro® Targeted Genotyping V2	_T		_T

Agilent
	Haloplex® HS Target Enrichment System
	SureSelectXT Target Enrichment			_T
	SureSelect® QXT Target Enrichment
Targeted enrichment	SureSelect XT HS2 DNA

Bioo Scientific
RNA-Seq	NEXTflex® Small RNA-Seq Kit v3

GenDx
HLA typing	NGSgo® HLA typing			_V

Illumina
DNA-Seq	Illumina DNA PCR-Free Prep	_V
	Illumina DNA Prep	_V		_T
	Nextera XT DNA Library Preparation Kit	_T		_V
	TruSeq DNA PCR-Free			_V
	TruSeq® Nano DNA			_V
Forensics	ForenSeq® DNA Signature Prep
HLA typing	TruSight HLA v2 Sequencing Panel			_V
RNA-Seq	COVIDSeq Test (1 plate per run)	_V
	COVIDSeq Test (2 plates per run)	_V
	Illumina Stranded mRNA Prep
	Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
	TruSeq RNA Exome			_V
	TruSeq Stranded mRNA			_V
	TruSeq Stranded Total RNA Library Prep (Human/Mouse/Rat)			_V
Targeted enrichment	16S Metagenomic Sequencing			_T
	Illumina DNA Prep with Enrichment
	Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment
	Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation
	Nextera DNA Exome
	TruSight Cardio
	TruSight Inherited Disease Sequencing Panel
	TruSight Oncology 500 DNA/RNA High-Throughput Kit (72 Samples)
	TruSight Rapid Capture
	TruSight® Cancer

Integrated DNA Technologies (IDT)
DNA-Seq	Lotus™ DNA Library Prep Kit
	xGen™ cfDNA & FFPE DNA Library Preparation Kit
	xGen™ NGS Hybridization Capture

MGI
DNA-Seq	MGIEasy FS DNA Library Prep
RNA-Seq	MGIEasy RNA Directional Library Prep Set

New England BioLabs (NEB)
DNA-Seq	NEBNext® Ultra™ II DNA			_V
RNA-Seq	NEBNext Ultra II Directional RNA Poly(A) mRNA Isolation			_V
	NEBNext Ultra II Directional RNA rRNA depletion			_V

Oxford Nanopore Technologies (ONT)
DNA-Seq	Ligation Sequencing Kit XL V14 (LSK114-XL)	_V
	Native Barcoding Kit 96 V14 (SQK-NBD114.96)
RNA-Seq	Midnight kit with ARTIC method for high-throughput SARS-CoV-2 sequencing

Pacific Biosciences (PacBio)
DNA-Seq	SMRTbell prep kit 3.0

QIAGEN
DNA-Seq	QIAseq® FX DNA
RNA-Seq	QIAseq Targeted RNA Panels
Targeted enrichment	QIAseq DIRECT SARS-CoV-2
	QIAseq Targeted DNA Panels

Quantabio
DNA-Seq	sparQ DNA Library Prep Kit

Roche
DNA-Seq	KAPA HyperPrep
	KAPA® HyperPlus
RNA-Seq	KAPA RNA HyperPrep with RiboErase (HMR)			_T
	RNA HyperPrep with mRNA Capture			_T

Thermo Fisher Scientific
DNA-Seq	Ion Xpress™
RNA-Seq	Oncomine™ Comprehensive Assay v3M
Targeted enrichment	Ion AmpliSeq® Library 2.0			_V

Twist and Celero
Targeted enrichment	Human Core Exome

Method available:

Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. Protocol was tested using water and/or reagents with Tecan instruments.

Method qualification in progress:

Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. It is currently being tested with reagents and commercial samples by the vendor.

Method qualified: _V _T _C

Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. Method was qualified using kit vendor’s guidelines, reagents and commercial samples. Libraries prepared with these methods meet the kit vendor’s specifications and/or perform comparably to those prepared manually. Sequenced libraries were assessed either by the vendor (_V vendor qualified), by Tecan (_T Tecan qualified) or by the customer (_C customer qualified).

Method custom developed:

Automated method developed according to specific customer need. Libraries tested by the customer.

要为可靠的二代测序本高质量的文库，有许多事情你必须做对，那么为什么你的液体处理流程还存在不必要的复杂性？

Freedom EVO NGS工作站上的NGS样本制备自动化提高了产量和可重复性，通过TouchTools™操作界面指导用户完成流程选择和工作站设置的每一步。

Freedom EVO NGS工作站

Freedom EVO NGS工作站配备了创新的气动移液技术，使用八通道移液臂(1)确保精确移液，从1,000 µl到0.5 µl 。该工作站包括三个Inheco CPAC装置；(2)为保证试剂的冷却，并为酶反应步骤提供最佳条件，Inheco Thermoshake加热振荡器(3)，一个96位Alpaqua 96S Super Magnet Plate磁力板分离器(4)和一个RoMa抓板机械臂(5)，用于高效的磁珠纯化。此外，紧凑的工作台面为多达12个吸头盒(6)提供了存储空间，允许更长的无人值守运行。

精确性: Freedom EVO的精确自动化确保了高质量结果所需的可重复性，有一系列合格的测序验证流程可供选择。
灵活性: 不受批次处理要求的限制。无论您需要处理6个、13个、19个、40个甚至96个样本，都只需要运行所需的，从而节省试剂
简单: 你不需要成为自动化专家。通过简单的触摸屏界面，您可以立即开启设备，快速设置运行，并对工作流程充满信心。

NGS Sample preparation Freedom EVO with Touchtools

TouchTools操作界面

TouchTools应用程序的启动屏幕让操作员通过触摸按钮选择所需的流程。循序渐进的的用户说明有助于避免在工作台面设置过程中的潜在错误，以确保正确的初始条件。然后，选择确认屏幕提供了一个摘要，作为开始运行前的最后检查，使实验室里的任何人都能轻松使用该仪器。

安装和支持

Freedom EVO NGS工作站提供了安装时可用的标准流程之一，包括测试和用户培训。可以随时安装其他流程。

Tecan期刊文章

Off-the-shelf NGS library prep for Ion Torrent™ sequencing

[TJ 03/2015]

The Leiden University Medical Center has integrated the Freedom EVO® NGS workstation into its molecular diagnostic testing and clinical research workflows. Taking advantage of this preconfigured solution, the center was quickly able to commission the platform for routine testing, while still having the flexibility to develop new protocols and conduct research studies.

Enhancing NGS sample prep with automation

[TJ 02/2014]

The University of North Carolina (UNC) has automated its major sample preparation protocols for next generation sequencing on a Freedom EVO® workstation, enabling more efficient processing.

GeT with the NGS program

[TJ 02/2014]

The GeT genomics facility near Toulouse has been developing a series of automated NGS protocols in collaboration with Tecan – including Illumina’s TruSeq® DNA and RNA kits, as well as Bioo Scientific’s NEXTflex™ PCR-Free Modules – on two Freedom EVO® workstations, helping to improve throughput and reliability for a wide range of projects.