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    自动化NGS文库制备

    NGS文库制备、质控与混样

    从每周只有几个样本到每天几百个样本，NGS样本的自动化制备使你能为（NGS）可重复地创建高质量的文库。

    Free Download: ONT's Ligation Sequencing Kit XL V14 automated on the DreamPrep NGS workstation

    免费下载:

    ONT's Ligation Sequencing Kit XL V14 automated on the DreamPrep® NGS workstation
    概述
    咨询价格




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    Tab 01 / 概述
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    帝肯的NGS文库预处理解决方案 旨在满足您的需求 并加速您的研究。

    把文库制备留给我们，把时间留给更重要的事。

    为Tecan试剂和第三方试剂盒开发自动化NGS文库制备流程已经过验证，并已准备就绪，以确保在任何实验室中都具有出色的性能。

    可靠和可重复的NGS文库制备方案。

    从即插即用到高度灵活的自动化解决方案。现在你可以自信地离开实验室了。

    技术成熟和知识专业的一体化解决方案。

    从试剂、自动化和耗材到应用的专业知识——我们支持您的每一步研究。

    产品特色

    从低通量到高通量，从一体化解决方案到OEM开发，我们全面的NGS文库制备解决方案使科学家能够节省文库准备时间并专注于更重要的事情。

    Tecan试剂
      

    • • 适用于广泛的样本类型
    • • DNA-Seq和RNA-Seq的输入量低至10 pg

    发现更多:

    方案手册

    MagicPrep™ NGS​
      

    • • 8个样本/运行
    • • 即插即用
    • • 与Tecan的NGS试剂(DNA和mRNA-seq)一起使用

    发现更多:

    方案手册

    紧凑型DreamPrep® NGS

    • • 每次运行样本可多至48个
    • • 台式的解决方案
    • • 开放平台，兼容多种NGS流程

    发现更多:

    方案手册

    DreamPrep® NGS​
      

    • • 每次运行多达96个样品
    • • 高通量
    • • 开放平台，兼容多种NGS流程

    发现更多:

    方案手册

    为OEM合作伙伴定制系统

    • • 根据您的要求和监管需求设计
    • • 针对OEM合作伙伴的试剂盒进行了优化

    发现更多:

    点击这里

    合作推进基因组学

    我们不断努力提供创新、易用和始终可靠的解决方案。

    NGS_Collaborations_v01_1140x316

     




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    Tab 02 / Dreamprep® NGS解决方案
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    DreamPrep NGS和紧凑型DreamPrep NGS

    用于NGS文库预处理的自动化解决方案

    灵活的配置，为不同的NGS流程提供均一和可测序的文库，人工干预最少，可以满足不同通量的需求。

    Watch the free webinar!

    两种解决方案 利用最先进的Fluent®自动化工作站，提供非凡的精度，无与伦比的效率，以及实现跨不同通量的无缝整合.

    DreamPrep NGS

    DreamPrep™ NGS

    • 高通量（高达384个样本/天
    • 52个板位
    • 配备了酶标仪和ODTC，用于实现无人值守的完整NGS工作流程

    输出

    • 使用Tecan NGS试剂盒 Celero™，每次运行96个DNA文库，时间少于4小时
    • 使用帝肯NGS试剂盒 Universal Plus™ mRNA，每次运行96个RNA文库，耗时9小时
    • 靶向DNA基因分型
      • 使用帝肯NGS试剂盒 Allegro®每天运行384个样本 
      • 使用帝肯NGS试剂盒 Celero和QIAseq SARS-CoV-2引物组合的帝肯 NGS流程，每天运行384个样本 

    包含的软件包

    阅读更多内容

    紧凑型DreamPrep NGS

    DreamPrep™ NGS Compact

    • 中低同量（8-48个样本/天）
    • 占地面积较小，有30个板位
    • 三种灵活的配置，满足客户的不同要求

    有三种配置可供选择，并可在任何时候实现升级

    基础款: 提高生产力，因为所有的液体转移和孵育都在平台的覆盖范围内

    中阶款: 延长无人值守时间，并通过简单地添加ODTC来实现PCR扩增

    全能款: 通过包括Infinite® 200 Pro Reader F Nano+，在你的NGS工作流程中整合定量和均一化功能

    包含的软件包

    阅读更多内容

    用我们的NGS方案拥抱卓越的液体处理新时代，彻底改变您的工作流程：

    开放而灵活的平台

    所有组件2在不同的文库制备试剂盒中都有很高的性能

     

    样本无损的快速质控和均一化

    通过集成酶标仪和NuQuant®3技术实现

    使用帝肯NGS试剂以实现最佳性能

    实现更快、更高效的工作流程

     

    处理速度快

    机械臂的并行移动提高了生产力

     

     

     

    用触摸屏进行直观交互

    人性化的界面，使您的日常操作更便利

     

    无人值守方案

    线上热循环仪（ODTC）可延长无人值守的时间

     

     

    用DreamPrep NGS解决方案扩展你的NGS工作流程

    平台结合了Fluent®自动化工作站、Infinite® 200 Pro Reader F Nano+和帝肯NGS文库制备试剂盒的先进技术，通过一个简单的自动化工作流程中生成可测序的NGS文库。

    MagicPrep™ NGS 只需按键就能进行NGS文库制备

    正在寻找更低的通量？MagicPrep NGS是一款新仪器，简单的按钮即可为Illumina测序平台制备NGS文库。

    阅读更多内容

    在几分钟内而不是几小时内进行稳健的质控

    帝肯的创新核心技术NuQuant3试剂和集成的Infinite酶标仪能在一个平板上同时测量终文库，不会造成不必要的样品损失。

    DreamPrep NGS简单、快速和精确。

    保存试剂和样品

    一个振动器模块和三个温控模块，用于优化文库制备

    Oxford Nanopore's Ligation Sequencing Kit XL V14 automated on the DreamPrep NGS workstation

    阅读更多内容

    DreamPrep NGS一直处于病毒监测的前沿

    阅读更多内容

    帝肯耗材提高了实验结果的可靠性

    批准功能（MAF）防止对已验证的协议进行未经授权的更改

    1) Number of samples processed in walk-away mode is determined by the NGS protocol

    2) Ring magnet plates and POGO® adapter with Spring Cushion Technology manufactured by ALPAQUA® Engineering, LLC. Beverly, USA.
    2) Thermal devices (Cold Plate Liquid-Cooled, CPLC) and ODTC® manufactured by Inheco© Industrial Heating and Cooling GmbH. Martinsried, Germany.
    2) BioShake®3000-T elm manufactured by QInstruments® GmbH. Jena, Germany.
    2) Infinite® 200 PRO F Nano+ Reader is a product of Tecan Trading AG, Switzerland.
    3) NuQuant® is a registered trademark of Tecan Group Ltd., Männedorf, Switzerland or of Tecan Genomics, Inc., Redwood City, USA.

    Example methods have not been validated. Please make a copy of these methods to customize them to accommodate and validate your workflow according to your desired intended use and laboratory protocols. Tecan makes no claims regarding the performance of the example methods.




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    Tab 03 / 文库制备试剂
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    用于Illumina测序平台的帝肯NGS文库制备试剂

    帝肯已经开发并优化了自己的NGS文库制备试剂，可用于广泛的样本类型。这些试剂已经在帝肯自动化平台上进行了验证，从样本到均一化文库，为您提供完整的解决方案 。

     展示更多

    Integrated

    Qualified

    Illumina合作方案

    帝肯与关键研究中心和Illumina合作，开发了经过优化、测试和测序验证的自动化NGS样本制备方案，以确保在任何实验室中都有出色的性能。

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    TruSeq Nano DNA

    TruSeq Nano DNA样本制备试剂盒能够对可用DNA量有限的样品进行有效检测。该试剂盒在Freedom EVO® NGS工作站上的自动化工作流程包括简单的基于磁珠的片段筛选，并且可以在一天之内完成多达48个样本的制备，只需很少的动手时间。

    下载应用说明

    TruSeq PCR Free

    TruSeq DNA PCR-Free样本制备试剂盒能够节省DNA样本的实验时间。用户友好的TouchTools™界面指导实验人员进行自动化设置，以最小的用户干预为单端、双端和index测序提供高度可重复的和可测序的DNA文库。

    下载应用说明

    Nextera XT

    Nextera XT DNA文库制备试剂盒能够从PCR扩增子、质粒和小基因组中有效地构建高质量的文库，使用的方案针对低至1ng的DNA样本而优化。

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    TruSeq Stranded mRNA

    RNA测序（RNA-Seq）是发现、分析和量化RNA转录本的有力方法。使用Illumina二代测序技术，特异链信息识别了从特定RNA转录本中获得的DNA链，增加了转录本注释的信心，并提高了反义调控的可见性。

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    TruSeq Stranded Total RNA

    Freedom EVO NGS工作站上Illumina TruSeq Stranded Total RNA流程的自动化实现了将总RNA转换为已知链的模板分子库，用户干预最少。Freedom EVO NGS工作站提供高质量的文库制备，交叉污染风险最小。

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    TruSeq RNA Access

    TruSeq RNA Access文库制备协议是对福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）档案组织样本进行低成本测序的理想解决方案。集成的富集步骤可以适应低浓度的DNA，自动工作流程允许并行构建多达48个文库，在用户干预有限和交叉污染风险最小的情况下生成高质量的文库。

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    Nextera Rapid Capture

    Nextera Rapid Capture流程的自动化友好工作流程与Freedom EVO NGS工作站相结合，为文库制备和外显子组富集提供了更快、更高效的解决方案。使用自动化的Nextera Rapid Capture流程，只需一天半的时间就能完成样本制备，第二天就能获得测序数据结果。

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    TruSight® HLA v2.0 Sequencing Panel

    人们对HLA基因测序的兴趣越来越大，因为与血清型分析等经典技术相比，它能更好地确定组织供体和受体的HLA概况。

    Illumina TruSight HLA v2.0测序板是一种可靠而简单的检测指标，旨在生成用于HLA特征分析的NGS文库。在Freedom EVO NGS工作站上的自动化工作流程允许对多达24个样本的11个HLA位点进行测序，最大限度地减少了交叉污染的风险和文库制备期间的人为错误。

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    TruSeq ® Custom Amplicon Low Input

    扩增子测序是一种有针对性的方法，用于鉴定和分析基因组特定区域的变异。PCR产物的测序提供了具有成本效益的变异鉴定和特征分析。Freedom EVO NGS工作站上的TruSeqCustom Amplicon Low Input文库制备工作流程的自动化提供了一个快速有效的解决方案。这种设置能够从低输入样本中生成高质量的文库--从低至10ng的基因组DNA开始。

    已验证的Illumina测序平台试剂

    Tecan与NGS样品制备试剂盒供应商合作，开发、测试和测序验证了NGS样品制备协议，使您有时间专注于分析测序结果。

    展示更多

    Verified

    NEBNext Ultra II Directional RNA

    NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina使用 “dUTP ”方法，即使从低质量的RNA中也能产生出色的产量和高质量的定向文库。每次可从广泛的输入材料中制备多达96个文库，10 ng - 1 µg总RNA用于poly(A) mRNA富集，5 ng - 1 µg用于rRNA消除。

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    NEBNext Ultra II DNA

    NEBNext Ultra II DNA文库制备工作流程结合了末端修复和dA-tailing步骤，以最少的纯化来减少样品制备时间。每次运行可制备多达96个文库，并使用例如NEBNext Multiplex Oligos for Illumina进行复用。

    该流程允许输入从500 pg到1 μg的DNA浓度以及FFPE样品中制备高度可重复的文库，以最小的用户干预提供1到96个样本的灵活处理。

    下载应用说明

    SureSelect XT Target Enrichment

    安捷伦的SureSelect XT Target Enrichment系统为人类和其他物种提供了一整套外显子组试剂盒，以及DNA和RNA捕获的定制试剂盒。

    单击此处获取应用说明，说明使用Freedom EVO NGS自动化工作站上的SureSelect XT目标富集系统并行处理多达48个样本。

    下载应用说明

    NimbleGen SeqCap EZ Library

    罗氏NimbleGen公司的SeqCap EZ文库制备试剂盒是一种基于解决方案的捕获系统，能从DNA测序库中富集整个外显子组或自定义感兴趣的区域。根据罗氏NimbleGen的规范，SeqCap EZ协议涵盖外显子组设计、基因板和定制内容设计。

    点击这里查看应用说明，描述了NimbleGen SeqCap EZ与KAPA™ HTP文库制备结合NimbleGen SeqCap接头试剂盒A和/或B的自动化流程。该流程允许制备多达96个文库，并捕获多达24个文库。

    下载应用说明

    Co-developed

    IonTorrent测序

    与赛默飞世尔科技公司合作开发的用于Ion AmpliSeq™文库制备的经过测序验证的灵活流程。

    展示更多

    Ion AmpliSeq libraries and panels

    Ion AmpliSeq Library Kit 2.0能在单孔中快速制备12-25,000个组合的PCR NGS文库。

    在Freedom EVO NGS工作站上，使用10ng的DNA或RNA，可以在6小时内完成多达96个样本的自动化文库制备。TouchTools操作界面最大限度地减少了动手时间和培训要求，指导用户完成流程选择和工作台面设置的每个阶段。

    下载应用说明




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    Tab 04 / 已验证的NGS流程
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    Please read the method definitions in the bottom section.

    		 NGS_Dreamprep-Fluent_300x300 DreamPrep NGS Compact NGS_Dreamprep-FreedomEvo_300x300
    Supplier Kit DreamPrep® NGS DreamPrep® NGS Compact Freedom EVO® NGS workstation
    Tecan
    DNA-Seq Celero™ DNA-Seq T      
      Celero™ EZ DNA-Seq T     T  
      Ovation® Ultralow System V2 T      
    RNA-Seq Revelo™ RNA-Seq T     T  
      Universal Plus Total RNA-Seq T      
      Universal Plus™ mRNA-Seq T     T  
    Targeted enrichment Celero™ EZ DNA-Seq and QIAseq SARSCoV- 2 Primer Panel for SARS-CoV-2 sequencing T      
    Targeted genotyping Allegro® Targeted Genotyping V2 T     T  
     
    Agilent
    Targeted enrichment Haloplex® HS Target Enrichment System      
      SureSelect XT HS2 DNA      
      SureSelectXT Target Enrichment     T  
      SureSelect® QXT Target Enrichment      
     
    Bioo Scientific
    RNA-Seq NEXTflex® Small RNA-Seq Kit v3      
     
    GenDx
    HLA typing NGSgo® HLA typing     V  
     
    Illumina
    DNA-Seq Illumina DNA PCR-Free Prep V      
      Illumina DNA Prep V     T  
      Nextera XT DNA Library Preparation Kit T     V  
      TruSeq DNA PCR-Free     V  
      TruSeq® Nano DNA     V  
    Forensics ForenSeq® DNA Signature Prep      
    HLA typing TruSight HLA v2 Sequencing Panel     V  
    RNA-Seq COVIDSeq Test (1 plate per run) V
    		   
      COVIDSeq Test (2 plates per run) V
    		   
      Illumina Stranded mRNA Prep      
      Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus      
      TruSeq RNA Exome     V  
      TruSeq Stranded mRNA     V  
      TruSeq Stranded Total RNA Library Prep (Human/Mouse/Rat)     V  
    Targeted enrichment 16S Metagenomic Sequencing     T  
      Illumina DNA Prep with Enrichment      
      Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment      
      Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation      
      Nextera DNA Exome      
      TruSight Cardio      
      TruSight Inherited Disease Sequencing Panel      
      TruSight Oncology 500 DNA/RNA High-Throughput Kit      
      TruSight Oncology 500 DNA/RNA Kit      
      TruSight Oncology 500 DNA/RNA with HRD      
      TruSight Rapid Capture      
      TruSight® Cancer      
     
    Integrated DNA Technologies (IDT)
    DNA-Seq Lotus™ DNA Library Prep Kit      
      xGen™ cfDNA & FFPE DNA Library Preparation Kit      
      xGen™ NGS Hybridization Capture      
     
    Lexogen
    RNA-Seq QuantSeq 3’ mRNA-Seq V2 Library Prep Kit with UDI      
     
    MGI
    DNA-Seq MGIEasy FS DNA Library Prep      
    RNA-Seq MGIEasy RNA Directional Library Prep Set      
     
    New England BioLabs (NEB)
    DNA-Seq NEBNext® Ultra™ II DNA     V  
    RNA-Seq NEBNext Ultra II Directional RNA Poly(A) mRNA Isolation     V  
      NEBNext Ultra II Directional RNA rRNA depletion     V  
     
    Oxford Nanopore Technologies (ONT)
    DNA-Seq Ligation Sequencing Kit XL V14 (SQK-LSK114-XL) V      
      Native Barcoding Kit 96 V14 (SQK-NBD114.96) V      
    RNA-Seq Midnight kit with ARTIC method for high-throughput SARS-CoV-2 sequencing      
     
    Pacific Biosciences (PacBio)
    DNA-Seq SMRTbell prep kit 3.0   V    
     
    QIAGEN
    DNA-Seq QIAseq® FX DNA      
    RNA-Seq QIAseq Targeted RNA Panels      
    Targeted enrichment QIAseq DIRECT SARS-CoV-2      
      QIAseq Targeted DNA Panels      
     
    Quantabio
    DNA-Seq sparQ DNA Library Prep Kit      
     
    Roche
    DNA-Seq KAPA HyperPrep      
      KAPA® HyperPlus      
    RNA-Seq KAPA RNA HyperPrep with RiboErase (HMR)     T  
      RNA HyperPrep with mRNA Capture     T  
     
    Thermo Fisher Scientific
    DNA-Seq Ion Xpress™      
    RNA-Seq Oncomine™ Comprehensive Assay v3M      
    Targeted enrichment Ion AmpliSeq® Library 2.0     V  
     
    Twist
    DNA-Seq Library Preparation EF 2.0 and Twist Universal Adapter System      
    Targeted enrichment Human Core Exome      
      Twist Target Enrichment Standard Hybridization v2      
     

    Method available:

    Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. Protocol was tested using water and/or reagents with Tecan instruments.

     

    Method qualification in progress:

    Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. It is currently being tested with reagents and commercial samples by the vendor.

     

    Method qualified: V T C

    Automated method developed according to the kit vendor’s published protocol. Method was qualified using kit vendor’s guidelines, reagents and commercial samples. Libraries prepared with these methods meet the kit vendor’s specifications and/or perform comparably to those prepared manually. Sequenced libraries were assessed either by the vendor (V vendor qualified), by Tecan (T Tecan qualified) or by the customer (C customer qualified).

     

    Method custom developed:

    Automated method developed according to specific customer need. Libraries tested by the customer.




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    Tab 05 / FREEDOOM® EVO NGS工作站
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    要为可靠的二代测序本高质量的文库，有许多事情你必须做对，那么为什么你的液体处理流程还存在不必要的复杂性？

    Freedom EVO NGS工作站上的NGS样本制备自动化提高了产量和可重复性，通过TouchTools™操作界面指导用户完成流程选择和工作站设置的每一步。

    Freedom EVO NGS工作站

    Freedom EVO NGS工作站配备了创新的气动移液技术，使用八通道移液臂(1)确保精确移液，从1,000 µl到0.5 µl 。该工作站包括三个Inheco CPAC装置；(2)为保证试剂的冷却，并为酶反应步骤提供最佳条件，Inheco Thermoshake加热振荡器(3)，一个96位Alpaqua 96S Super Magnet Plate磁力板分离器(4)和一个RoMa抓板机械臂(5)，用于高效的磁珠纯化。此外，紧凑的工作台面为多达12个吸头盒(6)提供了存储空间，允许更长的无人值守运行。

    精确性: Freedom EVO的精确自动化确保了高质量结果所需的可重复性，有一系列合格的测序验证流程可供选择。
    灵活性: 不受批次处理要求的限制。无论您需要处理6个、13个、19个、40个甚至96个样本，都只需要运行所需的，从而节省试剂
    简单: 你不需要成为自动化专家。通过简单的触摸屏界面，您可以立即开启设备，快速设置运行，并对工作流程充满信心。

    NGS Sample preparation Freedom EVO with Touchtools

    TouchTools操作界面

    TouchTools应用程序的启动屏幕让操作员通过触摸按钮选择所需的流程。循序渐进的的用户说明有助于避免在工作台面设置过程中的潜在错误，以确保正确的初始条件。然后，选择确认屏幕提供了一个摘要，作为开始运行前的最后检查，使实验室里的任何人都能轻松使用该仪器。

    安装和支持

    Freedom EVO NGS工作站提供了安装时可用的标准流程之一，包括测试和用户培训。可以随时安装其他流程。

    Tecan期刊文章

    Off-the-shelf NGS library prep for Ion Torrent™ sequencing
    [TJ 03/2015]

    The Leiden University Medical Center has integrated the Freedom EVO® NGS workstation into its molecular diagnostic testing and clinical research workflows. Taking advantage of this preconfigured solution, the center was quickly able to commission the platform for routine testing, while still having the flexibility to develop new protocols and conduct research studies.

    Enhancing NGS sample prep with automation
    [TJ 02/2014]

    The University of North Carolina (UNC) has automated its major sample preparation protocols for next generation sequencing on a Freedom EVO® workstation, enabling more efficient processing.

    GeT with the NGS program
    [TJ 02/2014]

    The GeT genomics facility near Toulouse has been developing a series of automated NGS protocols in collaboration with Tecan – including Illumina’s TruSeq® DNA and RNA kits, as well as Bioo Scientific’s NEXTflex™ PCR-Free Modules – on two Freedom EVO® workstations, helping to improve throughput and reliability for a wide range of projects.




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    Tab 06 / 质量检测
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    灵敏而快速的定量分析

    Infinite® F Nano+多功能酶标仪在一台紧凑型仪器中提供吸光度和高灵敏度的荧光读取模式。它结合了荧光检测的高灵敏度和读取多达384孔板的速度。

     

     阅读更多内容

    NGS文库定量是成功测序的一个关键步骤。准确确定可测序的分子量对新的高通量测序仪（如NovaSeq系统）意义重大。

    帝肯NuQuant技术

    Tecan NuQuant technology

    帝肯NuQuant®是一种新颖的文库定量方法，可以准确测量文库的摩尔浓度，而不需要单独进行片段大小分析。这种专有的方法使用了一种荧光标签，在文库制备过程中被嵌入到文库分子中。NuQuant与文库长度无关，允许使用荧光仪直接测量文库的摩尔浓度，如Infinite F Nano+多功能酶标仪。

    6分钟内完成文库的质控

    在Infinite F Nano+酶标仪上进行NuQuant文库定量，不需要额外的手工qPCR或毛细管电泳步骤，节省了大量时间、资源和宝贵的文库。

    在Fluent ®自动化工作站的96孔板上完成DNA终文库的纯化后，在Infinite酶标仪上测量文库和标准品的荧光量。然后为每个文库确定的摩尔值可用于均一化和Illumina平台的测序。

    其他定量分析方法

    Other quantification assays

    整合酶标仪用于定量

    DNA定量可以通过使用荧光染料(如PicoGreen®或QuantiFluor™)或测量整个DNA样本的吸光度来实现。DNA定量和均一化工作流程通常包括以下步骤：

    • 定量试剂的体系构建
    • 酶标仪测量DNA浓度
    • 计算稀释方案以实现各孔样本的目标浓度
    • 将DNA样本稀释至所需浓度
    阅读更多内容




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    Tab 07 / 文献资料
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